Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms