Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms