Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms