Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf3Q60765 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms