Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms