Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms