Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CttnQ60598 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms