Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3aQ60520 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms