Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncoa4Q5U4H9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncoa4Q5U4H9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms