Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms