Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myh1Q5SX40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms