Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms