Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmprss11eQ5S248 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss11eQ5S248 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms