Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RilpQ5ND29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RilpQ5ND29 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms