Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rapgef6Q5NCJ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms