Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim58Q5NCC9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim58Q5NCC9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms