Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1810065E05RikQ5NC41 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1810065E05RikQ5NC41 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1810065E05RikQ5NC41 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1810065E05RikQ5NC41 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1810065E05RikQ5NC41 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1810065E05RikQ5NC41 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms