Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf2Q5NC05 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms