Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chsy3Q5DTK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms