Protein–RNA interactions for Protein: Q571E4

Galns, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalnsQ571E4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GalnsQ571E4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GalnsQ571E4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms