Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 633.4 ms