Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shank3Q4ACU6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms