Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr7Q3V0I2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr7Q3V0I2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms