Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms