Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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