Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UZV7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UZV7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms