Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms