Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms