Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a11Q3USY0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a11Q3USY0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a11Q3USY0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms