Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms