Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fchsd2Q3USJ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms