Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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