Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms