Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms