Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc106Q3ULM0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms