Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6cQ3UHC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms