Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms