Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms