Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3U6N9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Q3U6N9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U6N9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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