Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud5Q3U2S4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms