Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vars2Q3U2A8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms