Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc17a7Q3TXX4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms