Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms