Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms