Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc127Q3TC33 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms