Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd8Q3TA59 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms