Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms