Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbtb38Q3LR78 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms