Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms