Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms